自身免疫：干燥綜合征病人體內檢測出多種自身抗體如抗核抗體、類風濕因子、抗RNP抗體、抗SSA抗體、抗SSB抗體等以及高球蛋白血癥，反映了B淋巴細胞本身的功能高度亢進和T淋巴細胞遏制功能低下。另外，本病T淋巴細胞亞群的變化即遏制性T細胞減少，反映了細胞免疫的異常;遺傳基礎：在對免疫遺傳的研究測定中，醫學家發現人類白細胞抗原中，HLA-DR3、B8與干燥綜合征密切相關，且這種相關又因種族的不同而不同，如西歐人與HLA-B8、DR3、DW52相關，人與HLA-DR53相關，這說明干燥綜合征有遺傳傾向;病毒感染：目前至少有三種病毒如EB病毒、巨細胞病毒、HIV病毒被認為與干燥綜合征有關，EB病毒能刺激B細胞增生及產生免疫球蛋白。有醫學家在原發性干燥綜合征患者中的涎腺、淚腺、腎臟標本中檢測出EB病毒及其DNA基因。