2012年9月(2012年9月1日零時至9月30日24時)，國內(不含臺港澳,下同)共報告法定傳染病553992例，死亡1656人。其中，甲類傳染病報告發病8例(鼠疫1例，霍亂7例)，死亡1人(鼠疫患者)。乙類傳染病中除傳染性非典型肺炎、脊髓灰質炎、人感染高致病性禽流感、甲型H1N1流感和白喉無發病、死亡病例報告外，其余21種傳染病共報告發病306819例，死亡1623人;報告發病數居前五位的病種依次為病毒性肝炎、肺結核、梅毒、細菌性和阿米巴性痢疾、淋病，占乙類傳染病報告發病總數的96%。

　　同期，國內共報告丙類傳染病發病247165例，死亡32人。報告發病數居前三位的病種依次為手足口病、其它感染性腹瀉病和流行性腮腺炎，占丙類傳染病報告發病總數的95%。