陰道的環境經常受到宿主的代謝產物、細菌本身的產物及外源性因素(性交、沖洗及其他干擾)而不穩定。陰道菌群非常復雜，除原蟲、真菌外，尚包括很多需氧菌及厭氧菌，這些微生物可分為共棲的及病理性的，都生長在～個共同的環境內，各微生物之間可能有桔抗作用。另一個影響其生長的是氫離子濃度，在pH3.8～4.2時，有利于共棲菌的繁殖，尤其是乳酸桿菌，這是健康陰道中的主要菌種，陰道液中的密度可達105～108ml，當陰道被微生物感染后，假使乳酸桿菌占優勢，仍能維持pH3.8～4.2，則不會致病，而且乳酸桿菌還能產生H202，對其他微生物有毒性作用而遏制其繁殖。其他如乳鏈球菌、腸桿菌、變形桿菌、加夫基球菌、韋永球菌等在陰道下端常見，平時不產生癥狀。陰道菌群之間彼此制約，使病理細菌不能有所作用，假使這種平衡被破壞，互相制約作用消失，所以氫離子濃度下降，乳酸桿菌失去優勢，病理菌得以繁殖，就產生癥狀。