在普通藍痣中，表皮中下部黑色素細胞較多，聚集成束，黑色素細胞長菱形，胞漿內充滿黑素顆粒。噬黑素細胞分布在黑素細胞附近，無樹枝狀突，含有粗大的色素顆粒。長的樹枝狀黑色素細胞多數是普通藍痣的特征。

　　細胞型藍痣黑素細胞呈樹枝狀，和較大菱形黑素細胞聚集成束，不規則交織，聚集成細胞島，可深達皮下組織，間有噬黑素細胞。藍痣細胞主要在真皮中下部，偶或皮下組織內，多分布于皮膚附屬器、神經和血管的周圍。

　　電鏡觀察：黑色素細胞主要位于真皮的深部，細胞成片分布，細胞突出不太明顯，胞質中含有大量黑素小體，黑素小體著色深淺不太一致，主要為第ⅲ期和第ⅳ期球形或橢圓形小體，也有少數大的含黑素球形體，細胞器相對較多。