根據臨床表現，尿檢查異常，不同程度浮腫，高血壓及腎功能異常，臨床上診斷慢性腎炎多無困難。若要確定系何種腎小球疾病或何種病理類型，需作腎穿刺活組織檢查。

　　慢性腎炎需與下列疾病作鑒別：

　　一、慢性腎盂腎炎　慢性腎盂腎炎晚期查有明顯蛋白尿和高血壓與慢性腎炎相似，但慢性腎盂腎炎多見于女性，病史中有泌尿系感染史，尿沉渣檢查白細胞數較多，甚或有白細胞管型，如涂片能找到細菌或尿培養陽性更有助于診斷。慢性腎盂腎炎患者的腎功能損害以腎小管損害為主，尿蛋白具有腎小管性蛋白(小分子量蛋白)的特征。靜脈腎盂造影，同位素腎圖及腎掃描，呈兩側腎臟損害不對稱，可作為鑒別診斷的重要依據。

　　二、原發性高血壓　久病高血壓亦引起腎臟損害，出現尿異常改變。但尿蛋白量常較少，罕有持續性血尿及紅細胞管型。一般無貧血及低蛋白血癥，如有腎功能損害，其程度也不如慢性腎炎嚴重。鑒別原發性高血壓與慢性腎炎高血壓型，病史很重要，前者高血壓病史在先，而后者則先有蛋白尿，亦可行腎活組織檢查鑒別。

　　三、與繼發于全身疾病的腎損害鑒別　不少全身性疾病引起繼發性腎損害，其表現似慢性腎炎。如過敏性紫癜性腎炎、糖尿病腎病、痛風性腎病、多發性骨髓瘤、感染性心內膜炎等，與慢性腎炎的鑒別可參見有關章節。